Lançado em julho de 2003, EX Ruby & Sapphire marcou o início da era EX e a primeira expansão sem o selo Wizards of the Coast, já sob licenciamento direto da Nintendo. Com 109 cartas, introduziu a mecânica dos Pokémon-ex, mais fortes que os normais, mas que cedem 2 cartas de prêmio ao serem nocauteados. Mewtwo ex é a carta mais valorizada do set, negociada hoje em torno de US$ 200 sem gradação.
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